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出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2020/07/30 13:51 UTC 版)
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クロマチン免疫沈降(クロマチンめんえきちんこう、Chromatin immunoprecipitation、略称 ChIP)はタンパク質に対する抗体を用いてDNAとタンパク質との相互作用(結合)を研究する方法の一つで、特定のタンパク質(転写因子など)が結合するDNA上の部位とその配列を明らかにする方法である。
現在では、さらにDNAチップによる標的DNA配列の同定を組み合わせた ChIP on chip や、DNAシークエンシングによるChIP-seqがよく用いられる。
従来行われている似た方法にはゲルシフトアッセイがあるが、これは無細胞系(in vitro:細胞をすりつぶした溶液)を用いて、特定のDNAに結合するタンパク質を探す方法であった。それに対し、ChIPは生きた細胞(in vivo)を用いて、タンパク質の側からDNA配列を探すのが特徴である。
方法の概略を以下に示す。
これにより、目的のタンパク質と結合するDNAの短い配列だけを選択することができる。
次の段階はDNA断片の同定である。これにより対象となるDNAがゲノム上のどこにあるかを知り、あるいはそのタンパク質が相互作用する新たな遺伝子を探し出すことができる。
DNA断片の同定には、従来はPCRが用いられた。ただしこれは配列がある程度予想されている場合にのみ有効である。
配列が全く不明の場合には、この段階でDNAチップを用いる"ChIP on chip"が有効である。これにより一度に数千種もの配列の確認が可能となる。
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出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2025/10/31 13:14 UTC 版)
チップまたはティップ
ものが欠けること。砕け散ること。断片状に刻むこと。
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/02/24 14:09 UTC 版)
木材、石、金属、陶磁器などの小片。ウッドチップは燻製の燃料、製紙原料、ネズミ飼育の床材、木質飼料の原料などに使われる。 超硬チップは回転系切断工具の刃先に用いられる(チップソー)。 チッピング (chipping) は工具の切刃に生ずる小さい欠け。 グラスなどガラス製食器の口元が欠けた状態。大きく破損した状態はブリケージという。 マイクロチップ、シリコンチップ、ICチップなどの集積回路。元は小片であるダイ(Die)を指すが、転じてパッケージ全体を指す場合もある。 小片や薄切りの食品。ポテトチップスやチョコチップなど。 ギャンブルで賭け金を表すために用いられる、札やコイン型の代替物(en:Casino token)。 CHIP (雑誌) - ドイツの雑誌 平成10年台風第12号(国際名:Chip)
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