HNRNPK
PDBに登録されている構造 PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj PDBのIDコード一覧 1J5K, 1KHM, 1ZZI, 1ZZJ, 1ZZK
識別子
記号	HNRNPK, CSBP, HNRPK, TUNP, AUKS, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K
外部ID	OMIM: 600712 MGI: 99894 HomoloGene: 81909 GeneCards: HNRNPK
遺伝子の位置 (ヒト) 染色体 9番染色体 (ヒト)[1] バンド データ無し 開始点 83,968,083 bp[1] 終点 83,980,616 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス) 染色体 13番染色体 (マウス)[2] バンド データ無し 開始点 58,391,142 bp[2] 終点 58,403,343 bp[2]
RNA発現パターン さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • 血漿タンパク結合 • 核酸結合 • DNA結合 • single-stranded DNA binding • RNA結合 • cadherin binding • protein domain specific binding • identical protein binding 細胞の構成要素 • 細胞質 • 膜 • 焦点接着 • 細胞核 • catalytic step 2 spliceosome • cell projection • エキソソーム • ポドソーム • spliceosomal complex • 細胞結合 • 細胞外マトリックス • 核質 • ストレス顆粒 生物学的プロセス • positive regulation of receptor-mediated endocytosis • regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • viral process • RNA processing • mRNA processing • regulation of low-density lipoprotein particle clearance • mRNA splicing, via spliceosome • シグナル伝達 • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of apoptotic process • RNAスプライシング • transcription by RNA polymerase II • RNA代謝プロセス 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種	ヒト	マウス
Entrez	3190	15387
Ensembl	ENSG00000165119	ENSMUSG00000021546
UniProt	P61978	P61979
RefSeq (mRNA)	NM_002140 NM_031262 NM_031263 NM_001318186 NM_001318187 NM_001318188	NM_001301340 NM_001301341 NM_001301343 NM_001301344 NM_001301345 NM_025279
RefSeq (タンパク質)	NP_001305115 NP_001305116 NP_001305117 NP_002131 NP_112552 NP_112553	NP_001288269 NP_001288270 NP_001288272 NP_001288273 NP_001288274 NP_079555 NP_001347419 NP_001347420 NP_001347422 NP_001347423 NP_001347424
場所 (UCSC)	Chr 9: 83.97 – 83.98 Mb	Chr 9: 58.39 – 58.4 Mb
PubMed検索	[3]	[4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト 閲覧/編集 マウス

HNRNPK（heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K、hnRNP K、protein K）は、ヒトではHNPNPK遺伝子にコードされるタンパク質である^[5]。細胞核に位置し、hnRNPの構成要素としてpre-mRNAに結合している。サルのホモログはH16として知られている。どちらのタンパク質も一本鎖DNAやRNAに結合し、大部分の遺伝子の転写を担うRNAポリメラーゼIIの活性を刺激する。DNAとRNAに対する相対的親和性は溶液条件によって異なり、逆相関している。すなわち、DNAとの強固な結合が促進される条件下ではRNAへの結合は弱まる^[6]。

HNRNPKのRNA結合ドメインに類似したドメインは他のタンパク質にも存在し、KHドメイン（K-homology domain）と呼ばれる。

HNRNPKは大腸がんと関係した研究の対象となっており、点変異を有するアイソフォームの発現を誘導する、がん細胞特異的なRNA編集があることが知られている^[7]。

機能

HNRNPKは普遍的に発現しており、ヘテロ核リボヌクレオタンパク質（hnRNP）のサブファミリーに属する。hnRNPはRNA結合タンパク質であり、ヘテロ核RNA（hnRNA）と複合体を形成する。hnRNPは核内でpre-mRNAと結合し、pre-mRNAのプロセシングのほか、その他mRNAの代謝や輸送に関する側面に影響を及ぼしているようである。全てのhnRNPは核内に存在しているが、その一部は核と細胞質の間を往復しているようである。

hnRNPは明確な核酸結合能を示す。HNRNPKは核質に位置し、RNAを結合する3つのKHドメインから構成される。HNRNPKはポリ(C)配列に強固に結合するという、他のhnRNPとは異なる結合特性を持つ。このタンパク質は細胞周期の進行にも関与していると考えられている。HNRNPK遺伝子には複数の選択的スプライシングバリアントが記載されているが、それらすべてに対して十分な特性解析がなされているわけではない^[8]。

Hnrnpkの双方のコピーに変異を有するマウスは胎生致死となる。双方のコピーをノックアウトしたマウスは胚発生14日以前に致死となる^[9]。

臨床的意義

Au-Kline症候群

HNRNPKの変異はAu-Kline症候群（英語版）の原因となる^[10]。

血液のがん

急性骨髄性白血病症例の約2%では、HNRNPK周囲の領域に欠失がみられる。さらに、Hnrnpk遺伝子の1コピーを人為的にノックアウトしたマウスの大部分は骨髄性白血病を発症し、1/3はリンパ腫、4%は肝細胞がんを発症する。こうしたマウスは野生型よりも小さく、器官の形成不全や高い出生後致死率（39%）を示す。マウスの寿命の中央値は野生型マウスの50％未満である。HNRNPKの欠乏は、特定の血球細胞の分化に関与する転写因子であるCEBPA（英語版）のp42アイソフォームや、DNA修復のための細胞成長の停止に関与するp21の発現レベルを特異的に低下させるようである^[11]。

HNRNPKの過剰発現もがんに寄与するようであるが、転写ではなく翻訳段階の機構を介していゐるようである^[11]。

相互作用

HNRNPKは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

• CSK（英語版）^[12]
• DDX1（英語版）^[13]
• HNRNPL（英語版）^[14]
• KHDRBS1^[15]
• PCBP2（英語版）^[14]
• PRMT1（英語版）^[16][17]
• PTBP1（英語版）^[14]

出典

関連文献

外部リンク

• Overview of all the structural information available in the PDB for UniProt: P61978 (Human Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K (HNRNPK)) at the PDBe-KB.