医薬品における殺菌剤（さっきんざい、英: anti-bacterial）とは、病原性を有する微生物を殺す、または増殖を抑止するための薬剤。殺菌薬とも。

ただし、抗生物質や抗真菌薬を除外し、微生物を非選択的に殺すものを呼ぶのが普通である。また医療機器の殺菌のみ、あるいは外用（皮膚）にのみ用いるものは消毒薬ということが多い。

例として以下のようなものがある。

• ヨウ素剤 - ヨードチンキ、ポビドンヨード
• 塩素類 - 次亜塩素酸ナトリウム、次亜塩素酸カルシウム（さらし粉）
• マーキュロクロム液（赤チン）
• グルコン酸クロルヘキシジン
• アクリノール
• アルコール類 - エタノール、2-プロパノール（イソプロパノール、イソプロピルアルコール）
• 過酸化水素水（オキシドール）
• 逆性石鹸 - 塩化ベンザルコニウム、塩化セチルピリジニウムなど
• フェノール類 - クレゾール石鹸液など

関連項目

• 殺菌
• 抗炎症薬
• 抗真菌薬
• ボロリン（英語版） ‐ インドで販売されている殺菌・傷薬。