概要はSSIAです。
ここではEntityをデータベースのテーブルそのままのPOJOとします。
原因
ここではis_active_sampleという名前のカラムに対して、isActiveSampleというBoolean/booleanのフィールドを持つEntityを挿入する状況をサンプルとして書きます。
LombokでこのEntityのアクセサを生成すると、下記のサンプルのように、アクセサの名前はisが省略されたgetActiveSample/setActiveSampleとなる場合があります。
import lombok.Setter; @Setter public class Sample { private boolean isActiveSample; }

一方これはデータベースのカラム名と異なっているため、BeanPropertySqlParameterSourceやBeanPropertyRowMapperといったマッパーはアクセサとカラム名を紐付けられず、INSERT/SELECTは失敗します。
対処
getIs.../setIs...という名前のアクセサを自分で実装することで、問題が解決します。
この時、自力でアクセサを実装したフィールドに対してLombokの自動生成は行われなくなります。