動的モード分解（DMD） 2024年02月18日 動的モード分解（dynamic mode decomposition, DMD）は時系列データの解析手法で、 時系列データを特定の周波数と減衰率を持ついくつかのモードに分解する。 フーリエ変換やウェーブレット変換に似た手法だが、より応用範囲が広そうだ。 動画のような空間的な要素を持つデー ... もっと読む
NetPyNE 2024年02月07日 最近は神経シミュレータの標準化が進み、使いやすさや効率性の面での開発が進んでいるようだ。Neruonをベースにしているが、チャネルからネットワークレベルまでの設定が可能で、高レベルでの実装や並列化、GUIによる操作やWebアプリも公開されている。結果の可視化なども含 ... もっと読む
DeepWonderによる神経細胞検出 2024年02月06日 二光子カルシウムイメージングデータにおける神経細胞の自動検出にはCNMFが用いられているが、深層学習を使用したものも存在している。 去年の四月のNature MethodsにDeepWonderというソフトも発表された。論文：Zhang Y, Zhang G, Han X, Wu J, Li Z, Li X, Xiao G, Xie H, ... もっと読む
