以下の内容はhttps://system-medicine.blog.jp/archives/2021-05.htmlより取得しました。

The Virtual Brainという全脳シミュレーションを行うソフトウェアを見つけた。NEURONなどの神経シミュレータは細胞集団などのミクロレベルでの活動が主だが、こちらはマクロなレベルでの脳活動のシミュレーションを行うことが出来る。方法としては平均場近似を用いている。論 ... もっと読む

前の記事でも取り上げたBrian2のアストロサイトのシミュレーションをやってみた。 デモコードは以下のBrian2のdocumentationに公開されている。ただし、このコードには抑制性ニューロンの座標が設定されていないバグがあると思われる。https://brian2.readthedocs.io/en/stab ... もっと読む

去年の12月にNature Methods誌に新しいセグメンテーション手法が発表された。論文：https://www.nature.com/articles/s41592-020-01008-zGitHub：https://github.com/MIC-DKFZ/nnUNetこれ自体が新しいアーキテクチャというわけではなく、データを与えると最適なセグメンテー ... もっと読む

物体検出やセグメンテーションのタスクにおいて、画像の解像度によらない特徴量抽出は重要となる。このようなスケール不変性(scale invariance)を実装する技術としてはFPNとASPPがある。・Feature Pyramid Network (FPN)これは、抽出された特徴マップをアップサンプリングし ... もっと読む


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