グリアを取り入れたSNN 2020年12月30日 SNNは生体の神経回路に近いことが特徴であるが、本当に生体を模倣するならグリア細胞も考慮しなければならないと思う。調べてみるとアストロサイトと取り入れたSNNがいくつか発表されていた。1. Spiking Neuronal-Astrocytic Network (SNAN)これはIntelのLoihiに組み込むモジ ... もっと読む
BCMなどのシナプス学習則 2020年12月30日 神経の学習則で古くから提唱されているのがヘブ則で、ニューロンが別のニューロンを発火をさせるとシナプス結合が強くなるというものだ。（局所的な変化によるシナプスの可塑性が全体としての記憶を形成している？）多くの実験で整合性が確認されているが、シミュレーション ... もっと読む
カーネル法と再生核ヒルベルト空間 2020年12月20日 Deep Learningが流行する前の機械学習では、カーネル法が注目されていたようだ。カーネル法では、線形では扱えないようなデータを非線形の変換によって高次元の特徴空間に写像して線形的な解析を可能にする。特にPCAやSVMではカーネル法を用いることで非線形なデータも扱える ... もっと読む
CASCADEとDeepCINAC 2020年12月18日 前にも少し書いたが、神経細胞の活動推定(Sike Rate Inference)の技術は様々なものが存在している。例えばCaImAnに付属するdeconvolutionなどがある。 今年になってDeep Learingを使用したソフトが２つ発表された。CASCADE論文：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/20 ... もっと読む
NAOMiシミュレータ 2020年12月18日 神経シミュレータには色々あるが、NAOMi(Neural Anatomy and Optical Microscopy)というシミュレータを見つけた。これは2光子顕微鏡のカルシウムイメージングのシミュレータで、リアルな顕微鏡動画を作成することが出来るようだ。論文：https://www.biorxiv.org/content/10.1 ... もっと読む
VERTEXシミュレータ 2020年12月16日 VERTEX(Virtual Electrode Recording Tool for EXtracellular potentials)という神経シミュレーションのMATLABのツールボックスを見つけた。論文：https://link.springer.com/article/10.1007/s00429-014-0793-xホームページ：http://vertexsimulator.org/主にLFP(Local fiel ... もっと読む
グレンジャー因果性と移動エントロピー 2020年12月15日 グレンジャー因果性(Granger causality)では、2つの時系列データにおいてVARモデル（ベクトル自己回帰モデル）を作って一方のデータからの係数が0になるかでF検定を行う。名前に「因果性」とあるが、実際は予測の役に立つかどうかを示すものであり厳密な因果推論をしているわ ... もっと読む
