Thoriumは「THORIUM.BAT」（バッチファイル）をクリックすることでポータブルモードで起動できますが、HTML書類ファイル（拡張子が.htmlのファイル）などをクリックしてもポータブルモードのまま起動できません。
そこで、Thoriumの「THORIUM.BAT」をexe化して関連づけ起動ができるようにします。
batファイルをexeファイルに変換
Batch To Exe Converterで「THORIUM.BAT」をexeファイル（「THORIUM.exe」）に変換します（最新バージョンは使いにくいので旧バージョンの2.4.8.0を使っています）。
※ exeファイル実行時（batファイルと同じように）コマンドプロントが表示されないように「可視性がないアプリケーション」にチェックしています。
このままだとThoriumのアイコンが表示されないので、BeCyIconGrabberでThoriumの実行ファイル本体から抽出したアイコン「THORIUM.ico」を設定しておきます。
（アイコンの抽出にはBeCyIconGrabber Portable Dev Test 4を使いました）。
設定が終わったらコンパイルをクリック、「THORIUM.exe」が作成されます。
ポータブル版の実行ソフトを既定のアプリに設定
作成した「THORIUM.exe」をPORTABLE Registratorで既定のアプリに設定します。
PORTABLE Registratorを実行し即終了で「PortableRegistrator.conf」が生成されます。
生成された「PortableRegistrator.conf」をメモ帳などで開いてGeneric Web-BrowserのOpenParametersを「-url "%1"」から「"%1"」に変更（「-url 」を削除）保存します。
再度、PORTABLE Registratorを実行、Generic Web-Browserを選択、「THORIUM.exe」を指定してREGISTERをクリックします。
Windowsの設定→アプリ→既定のアプリ→Web ブラウザーのアプリを「THORIUM.exe」に設定して完了です（Thoriumの書類アイコン「chrome.ico」も作ったのでよければ）。
上記の拡張子（.htm, .html, .shtml, .xht, xhtml）以外は“関連付け”を変更することのできるフリーソフトで個別に対応します（自分は萬屋を使っています）。
まとめ
以上の設定でThoriumをポータブルモードのまま関連づけ起動できますが、完璧ではなくファイル名に「スペース」があると起動できません。誰か解決策を教えてください...。
ちなみに元ネタがThoriumのGitHubのIssuesにあったのですが、なぜかなくなっていたので思い出しながらこの記事を書きました。
