ビッグエンディアンで２バイト、１バイト、１バイトと格納されている文字列が来ていたとします。
こいつをリトルエンディアンで置き換えるには先頭だけ入れ替えてあげればいいですね。
$ echo AD7399AF | sed -e "s/\([1-9A-F]\{2\}\)\([1-9A-F]\{2\}\)\(.*\)/\\2\\1\\3/g"
73AD99AFビッグエンディアンで２バイト毎が３個……とかいう構成なら、sedで1バイト(=2文字)に切り分け、
awkのprintf フォーマットをつかってこう書いた方が楽かも……
$ echo AD7399AF51CD | sed 's/.\{2\}/& /g' | awk -F " " '{printf $2$1 $4$3 $6$5}'
