左は Cube 、右は Quad の Material に動画を設定して再生しています。
こちらにサンプルを上げています。 5.6 はまだベータなので変更が発生する可能性も有るので詳細な解説は正式版がリリースされた後に書きます。
(2017/04/03 追記)
正式版がリリースされたので解説記事書きました。
Unity 5.6 から使える VideoPlayer で透過付き動画を再生する方法 - 強火で進め
http://d.hatena.ne.jp/nakamura001/20170403/1491221194
(追記ここまで)
関連情報
Unity - Manual: [BETA] Video Player
https://docs.unity3d.com/560/Documentation/Manual/VideoPlayer.html
