現行のブラウザの正式版ではCanvasの2Dを使った場合はIE 9、WebGLを使った場合はChrome 15が一番パフォーマンスが良いみたいです。
アルファの話になりますがOpera 12アルファの描画性能はChrome 15の44%高速みたいです。これはリリースが楽しみですね。
C++とDirectXの組み合わせでテストしたスコアも有りますが流石に段違いな感じですね。最近はブラウザの描画性能が上がったと言われていますがまだまだ、ネイティブアプリとの差は大きい様です。
HTML5 2D gaming performance analysis - Scirra.com
http://www.scirra.com/blog/58/html5-2d-gaming-performance-analysis
