ON化

以下は複数行で記載していますが、1行で実行してください

reg add 
  "HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Internet Settings"
  /v "AutoConfigURL" /t REG_SZ /d "http://hoge/proxy.pac" /f

OFF化

reg delete
  "HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Internet Settings"
  /v "AutoConfigURL" /f

参考url

Proxy設定の自動検出のON/OFFについて（その2）│チラシの裏