透過色指定でビットマップを描くときは　TransparentBlt() を使うといい

VC2005だとCDCにTransparentBlt()関数が追加されたみたい。

哀しいかなVC6で作ることになってしまったら、BitBlt関数の代わりに
msimg32.libをリンクして、：：TransparentBlt()を使うといいです。

ヘルプはこちら

• http://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/cc428776.aspx

最後の引数で透過色/透明色を指定。赤を透明にするなら

RGB(0xff,0,0)

ということ。