Spring BootでapplicationContext.xmlのような自前の構成ファイルを読み込ませるには

src/main/resourcesに適当な名前（ここではapplicationContext.xml）でSpringの構成ファイルを作成します。そして、Appクラスに以下のようにImportResourceアノテーションをつければOKです。

@SpringBootApplication
@ImportResource("classpath:applicationContext.xml")
public class App {
  ...
}