プライベートリポジトリで GitHub Pages をプライベートで作った時にカスタムドメインを付与したらいつまでもHTTPSが有効になりませんでした。
公式ホームページを見ると public にしないといけないようなので以下を実施しました。
GitHub Pages からカスタムドメインを削除する
- GitHub Pages に Public にする
<user>.github.ioまたは<organization>.github.ioを CNAME として追加する（この前まではプライベート用のランダムなURLを使ってた）- GitHub Pages でカスタムドメインをセットする
これで数分待ったらうまく行きました。
