原因はWindows Subsystem for Linuxのインストール処理の途中でapt-getか何かがネットワークアクセスをしているが、
Proxyの設定がされていないのでインターネットと通信できず処理が止まっていたためだった。インストール完了前のUbuntuで動いているapt-getの話なので
プロキシ設定ができず困ったが、タスクマネージャでプロセス名が bash のプロセスを「タスクの終了」で終了させるとインストールが進んだ。
こんな裏技があったとは。。
ネットで検索するとavastが悪さをしていたという情報もあり、何らかの原因でネットワークに通信出来ない場合に発生する現象と思われる。
参考：
