chipwispererというツールをこのページを参考にインストールしようとしていて，homebrewでscipyを入れる手順があった．scipyのインストールには成功したが，Pythonでモジュールが見つからない．pyenv環境から上手いこと参照されてないのでは？と思ったらそうだったという内容です．
現象
Homebrewでscipyを入れた．正しくインストールは完了したのに，いざPythonで使ってみようとするとImportError: No module named scipyみたいなことになる．
原因
Homebrewのインストール先にライブラリが置かれるのでpyenvのPythonから参照できないのが原因です．
Homebrewのインストール先
Homebrewで入れたPythonパッケージは，/usr/local/Cellar/配下に入る．これをpyenvのPythonが参照できてない．
例えばscipyをインストールした場合は，
/usr/local/Cellar/scipy/1.0.0_2/lib/python2.7/site-packages/scipyにPython2.7用のscipyが入っている．
pyenvのPythonはどこにある？(どうやってバージョン切り替えしている？)
pyenvをセットアップする時に意識するかもしれないが，pyenvは~/.pyenvの中に~/.pyenv/versions/というのを作って，さらにこの中に2.7.14とか3.6.3とかを作ってこれを切り替えている．
おそらくecho $PYENV_ROOTとかで確認できる (私の場合はPYENV_ROOTを変更している．そうするのが普通？)．
そして，Python 2.7.14のsite-packegesディレクトリは，
$PYENV_ROOT/versions/2.7.14/lib/python2.7/site-packages/にある．
対処
いくつか対処法はありそうだが，ここではシンボリックリンクを貼る方法を紹介する．
以下のようにシンボリックリンクを貼ることで対処可能．
% ln -s /usr/local/Cellar/scipy/1.0.0_2/lib/python2.7/site-packages/scipy/ /usr/local/var/pyenv/versions/2.7.14/lib/python2.7/site-packages
感想
pipで入れられるなら極力pipで管理した方がシンボリックリンクとかpathの設定とかしなくて済むので良さそうな気がしますが，
今回はHomebrewでのインストールにおける対処を行いました．
